胸外科由原北京301胸外科王芳泽教授创建，开院之初即广泛开展各类型普胸手术及胸部创伤的救治，包括肺癌根治、食管癌根治、肺叶切除、联合肺叶切除、全肺切除、纵肿瘤切除、胸膜纤维板剥除、心包剥脱、胸壁肿瘤切除及胸廓重建，爪型接骨板内固定治疗多发肋骨骨折及连枷胸、各类胸外伤的抢救及急诊手术等。
目前科室已成功引进微创技术，熟练开展全胸腔镜辅助下肺癌根治术、食管癌及贲门癌根治术、肺叶及亚肺叶切除术、纵肿瘤切除、肺大疱切除及肺减容手术、食管良性肿瘤剥除、责门失迟缓症治疗、手汗症胸交感神经离断、胸膜活检、肋骨肿瘤切除、肋骨折内固定及血气胸、膈肌破裂等其它各类胸外伤急救手术。其中单操作孔(两孔法)全胸腔镜手术在本地区具有明显的技术优势。
2024年，澳洋医院签约成为“上海长海医院胸外科专科联盟”成员单位，科室积极推动与上海长海医院胸外科开展项目合作，对科室科研技术能力的提升和诊疗水平的增强提供强有力的支持。
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